Cre-loxP重组酶系统包括Cre重组酶和loxP序列,是一种特定位点的重组技术。Cre重组酶(cyclization recombination)是从P1噬菌体中发现,属于λInt酶超基因家族。Cre重组酶基因编码区序列全长1029bp,编码由343个氨基酸组成的38kDa单体蛋白。它不仅具有催化活性,而且与限制酶相似,它不借助任何辅助因子,能识别特异的DNA序列,即loxP位点,使loxP位点间的基因序列被删除、插入、易位或倒位。
LoxP(locus of X(cross)-overinP1)序列是由两个13bp反向重复序列和中间间隔的8bp序列共同组成,Cre在催化DNA链交换过程中与DNA共价结合,反向重复序列是Cre重组酶的特异识别位点,而8bp的间隔区域决定了loxP位点的方向。
图:CRE作用原理